Cenicacelaya obtuvo en 1978 el Master of Arts in Urban Design, de la Escuela de Arquitectura de Oxford (Inglaterra). Ha sido Dean (Director) de la Escuela de Arquitectura de la Universidad de Miami.
Javier Cenicacelaya e Iñigo Saloña fueron nominados Visiting Scholars por la Fundación John Paul Getty, Los Angeles, en 1993. Su obra cubre una gran variedad de edificios, de residencial a público. Ha realizado proyectos fuera de España, como en Bruselas y Miami o en Berlín. Junto a Saloña, fue galardonado con el Premio Rafael Manzano de Arquitectura 2014.
Es, asimismo, director de la publicación DPArquitectura.